Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930596D02RikQ3V0H9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms