Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm44Q3V089 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm44Q3V089 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbm44Q3V089 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm44Q3V089 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm44Q3V089 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbm44Q3V089 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms