Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E330034G19RikQ3UWX6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330034G19RikQ3UWX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms