Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdc42bpaQ3UU96 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdc42bpaQ3UU96 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cdc42bpaQ3UU96 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cdc42bpaQ3UU96 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdc42bpaQ3UU96 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms