Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtl4Q3URY0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtl4Q3URY0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms