Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5460Q3UQ97 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5460Q3UQ97 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5460Q3UQ97 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms