Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UPC7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Q3UPC7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UPC7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UPC7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UPC7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UPC7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3UPC7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3UPC7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q3UPC7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q3UPC7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q3UPC7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3UPC7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q3UPC7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms