Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrch2Q3UMG5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrch2Q3UMG5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrch2Q3UMG5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms