Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mccc2Q3ULD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mccc2Q3ULD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.7 ms