Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxnd1Q3UH93 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxnd1Q3UH93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxnd1Q3UH93 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plxnd1Q3UH93 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnd1Q3UH93 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plxnd1Q3UH93 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms