Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdhd2Q3UGR5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdhd2Q3UGR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdhd2Q3UGR5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdhd2Q3UGR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms