Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem109Q3UBX0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmem109Q3UBX0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem109Q3UBX0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem109Q3UBX0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms