Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CenplQ3U3S3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenplQ3U3S3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenplQ3U3S3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms