Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf6Q3TWW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf6Q3TWW8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms