Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrx1Q3TL44 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrx1Q3TL44 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrx1Q3TL44 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms