Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf2f1Q3THK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2f1Q3THK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms