Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M3Q31093 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M3Q31093 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M3Q31093 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M3Q31093 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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