Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT4

Zgrf1, Protein ZGRF1, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zgrf1Q0VGT4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zgrf1Q0VGT4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zgrf1Q0VGT4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zgrf1Q0VGT4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zgrf1Q0VGT4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms