Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2b3Q0VF55 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2b3Q0VF55 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms