Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Lrriq1Q0P5X1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Lrriq1Q0P5X1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lrriq1Q0P5X1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lrriq1Q0P5X1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lrriq1Q0P5X1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lrriq1Q0P5X1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms