Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cib3Q0P523 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cib3Q0P523 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cib3Q0P523 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms