Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MitfQ08874 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MitfQ08874 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MitfQ08874 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MitfQ08874 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MitfQ08874 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MitfQ08874 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MitfQ08874 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MitfQ08874 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms