Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfdp1Q08639 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfdp1Q08639 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms