Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnma1Q08460 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnma1Q08460 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnma1Q08460 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms