Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntn3Q07409 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntn3Q07409 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn3Q07409 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms