Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Fmn1Q05860 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Fmn1Q05860 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Fmn1Q05860 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Fmn1Q05860 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Fmn1Q05860 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fmn1Q05860 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fmn1Q05860 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms