Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Top1Q04750 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1Q04750 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top1Q04750 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1Q04750 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1Q04750 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Top1Q04750 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top1Q04750 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1Q04750 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1Q04750 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1Q04750 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1Q04750 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1Q04750 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms