Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddr1Q03146 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddr1Q03146 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms