Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgfr4Q03142 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fgfr4Q03142 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgfr4Q03142 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgfr4Q03142 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms