Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoa1Q00623 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoa1Q00623 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms