Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps45P97390 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps45P97390 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps45P97390 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps45P97390 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps45P97390 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps45P97390 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps45P97390 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps45P97390 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms