Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lig3P97386 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig3P97386 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig3P97386 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig3P97386 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig3P97386 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig3P97386 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig3P97386 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lig3P97386 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig3P97386 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig3P97386 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig3P97386 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig3P97386 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lig3P97386 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lig3P97386 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms