Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis3P97368 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis3P97368 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Meis3P97368 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Meis3P97368 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Meis3P97368 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Meis3P97368 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Meis3P97368 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis3P97368 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms