Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh8P97291 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh8P97291 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh8P97291 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh8P97291 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms