Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TnikP83510 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TnikP83510 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TnikP83510 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnikP83510 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnikP83510 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnikP83510 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnikP83510 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TnikP83510 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnikP83510 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnikP83510 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnikP83510 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnikP83510 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TnikP83510 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnikP83510 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnikP83510 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnikP83510 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnikP83510 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnikP83510 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TnikP83510 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnikP83510 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnikP83510 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TnikP83510 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TnikP83510 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnikP83510 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TnikP83510 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnikP83510 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnikP83510 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TnikP83510 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnikP83510 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnikP83510 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TnikP83510 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnikP83510 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TnikP83510 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TnikP83510 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TnikP83510 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TnikP83510 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnikP83510 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnikP83510 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TnikP83510 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnikP83510 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnikP83510 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TnikP83510 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnikP83510 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnikP83510 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnikP83510 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TnikP83510 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnikP83510 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnikP83510 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnikP83510 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TnikP83510 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnikP83510 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnikP83510 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnikP83510 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TnikP83510 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TnikP83510 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TnikP83510 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TnikP83510 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TnikP83510 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TnikP83510 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnikP83510 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnikP83510 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnikP83510 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TnikP83510 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnikP83510 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnikP83510 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TnikP83510 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TnikP83510 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnikP83510 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnikP83510 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnikP83510 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnikP83510 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TnikP83510 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TnikP83510 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnikP83510 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TnikP83510 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TnikP83510 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnikP83510 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TnikP83510 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TnikP83510 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TnikP83510 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TnikP83510 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnikP83510 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnikP83510 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnikP83510 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TnikP83510 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TnikP83510 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms