Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabpb2P81069 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabpb2P81069 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabpb2P81069 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms