Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CiitaP79621 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CiitaP79621 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CiitaP79621 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CiitaP79621 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CiitaP79621 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CiitaP79621 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CiitaP79621 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CiitaP79621 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CiitaP79621 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CiitaP79621 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CiitaP79621 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CiitaP79621 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CiitaP79621 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CiitaP79621 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms