Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shox2P70390 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shox2P70390 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shox2P70390 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shox2P70390 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shox2P70390 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shox2P70390 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shox2P70390 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shox2P70390 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shox2P70390 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shox2P70390 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shox2P70390 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shox2P70390 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shox2P70390 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shox2P70390 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shox2P70390 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shox2P70390 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms