Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb4bP68372 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb4bP68372 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubb4bP68372 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb4bP68372 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms