Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspd1P63038 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hspd1P63038 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hspd1P63038 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hspd1P63038 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hspd1P63038 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hspd1P63038 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hspd1P63038 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms