Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snrpd1P62315 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd1P62315 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd1P62315 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms