Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnrpfP62307 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnrpfP62307 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms