Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnnP61807 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnnP61807 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnnP61807 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnnP61807 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnnP61807 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnnP61807 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnnP61807 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnnP61807 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnnP61807 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnnP61807 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnnP61807 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnnP61807 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnnP61807 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnnP61807 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnnP61807 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnnP61807 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnnP61807 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnnP61807 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnnP61807 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnnP61807 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnnP61807 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnnP61807 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SnnP61807 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SnnP61807 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnnP61807 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnnP61807 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnnP61807 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnnP61807 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnnP61807 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnnP61807 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnnP61807 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnnP61807 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnnP61807 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnnP61807 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnnP61807 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnnP61807 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnnP61807 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnnP61807 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SnnP61807 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnnP61807 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnnP61807 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnnP61807 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnnP61807 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnnP61807 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnnP61807 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnnP61807 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnnP61807 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnnP61807 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnnP61807 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnnP61807 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnnP61807 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnnP61807 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms