Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Depdc5P61460 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Depdc5P61460 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Depdc5P61460 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Depdc5P61460 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Depdc5P61460 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Depdc5P61460 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Depdc5P61460 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Depdc5P61460 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Depdc5P61460 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Depdc5P61460 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Depdc5P61460 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Depdc5P61460 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Depdc5P61460 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Depdc5P61460 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Depdc5P61460 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms