Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nol4P60954 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nol4P60954 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nol4P60954 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nol4P60954 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nol4P60954 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nol4P60954 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nol4P60954 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nol4P60954 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nol4P60954 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nol4P60954 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 336.2 ms