Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Anks1aP59672 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Anks1aP59672 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Anks1aP59672 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Anks1aP59672 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Anks1aP59672 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Anks1aP59672 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Anks1aP59672 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms