Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
P58686 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P58686 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P58686 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
P58686 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P58686 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P58686 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
P58686 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
P58686 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P58686 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P58686 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P58686 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P58686 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P58686 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P58686 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P58686 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P58686 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P58686 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
P58686 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P58686 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P58686 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P58686 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P58686 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P58686 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P58686 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P58686 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P58686 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P58686 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P58686 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P58686 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P58686 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P58686 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P58686 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P58686 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P58686 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P58686 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P58686 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P58686 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P58686 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P58686 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P58686 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
P58686 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
P58686 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P58686 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P58686 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P58686 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P58686 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms