Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtnsP57757 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtnsP57757 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtnsP57757 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtnsP57757 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtnsP57757 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtnsP57757 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtnsP57757 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtnsP57757 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtnsP57757 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CtnsP57757 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtnsP57757 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtnsP57757 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtnsP57757 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtnsP57757 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CtnsP57757 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtnsP57757 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtnsP57757 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtnsP57757 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtnsP57757 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtnsP57757 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtnsP57757 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtnsP57757 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtnsP57757 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtnsP57757 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CtnsP57757 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtnsP57757 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtnsP57757 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CtnsP57757 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtnsP57757 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms