Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp25P57080 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp25P57080 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp25P57080 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp25P57080 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp25P57080 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp25P57080 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp25P57080 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp25P57080 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp25P57080 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms