Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rad23bP54728 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rad23bP54728 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rad23bP54728 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad23bP54728 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad23bP54728 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms